Diterangkan: Apakah 'nilai CT' dalam ujian Covid-19, dan mengapa ia penting?

Nilai ambang kitaran muncul dalam ujian RT-PCR untuk coronavirus, dan menentukan sama ada seseorang itu positif Covid-19 atau tidak. Sejauh manakah ia berkait dengan viral load dan keterukan penyakit?

Ujian RT-PCR mengesan virus; Nilai Ct menetapkan penanda aras sama ada seseorang itu akan dikira sebagai positif. (Foto Ekspres: Amit Mehra)

Di antara pelbagai istilah saintifik yang wabak Covid-19 telah dijadikan sebahagian daripada perbendaharaan kata awam, salah satunya ialah 'nilai Ct' dalam ujian RT-PCR untuk menentukan sama ada pesakit positif Covid-19.

Ini adalah subjek permintaan baru-baru ini yang dihantar oleh kerajaan Maharashtra kepada Majlis Penyelidikan Perubatan India (ICMR). Negeri meminta kejelasan sama ada dinasihatkan untuk menganggap seseorang sebagai Covid-negatif jika nilai Ct lebih daripada 24 dan orang itu tanpa gejala. Pegawai negeri berkata pelbagai dokumen ICMR telah menyebut nilai Ct yang berbeza dan terdapat pandangan yang berbeza walaupun di kalangan Niti Aayog dan Pusat Kawalan Penyakit Kebangsaan.

Beberapa hari kemudian, KP ICMR menulis semula kepada Setiausaha Kesihatan negeri bahawa ICMR telah mengambil input daripada makmal virologi di seluruh negara untuk mencapai satu pemotongan nilai Ct. Semua pesakit dengan nilai Ct kurang daripada 35 boleh dianggap sebagai positif manakala mereka yang mempunyai nilai Ct melebihi 35 boleh dianggap sebagai negatif, kata ICMR.

Tetapi apakah nilai Ct?

Pendek untuk ambang kitaran, Ct ialah nilai yang muncul semasa ujian RT-PCR, standard emas untuk pengesanan coronavirus SARS-CoV-2 . Dalam ujian RT-PCR, RNA diekstrak daripada swab yang dikumpul daripada pesakit. Ia kemudian ditukar kepada DNA, yang kemudiannya dikuatkan. Penguatan merujuk kepada proses mencipta berbilang salinan bahan genetik — dalam kes ini, DNA. Ini meningkatkan keupayaan ujian untuk mengesan kehadiran virus. Penguatan berlaku melalui satu siri kitaran — satu salinan menjadi dua, dua menjadi empat, dan seterusnya — dan selepas beberapa kitaran jumlah virus yang boleh dikesan dihasilkan.

Menurut nasihat ICMR, nilai Ct bagi tindak balas RT-PCR ialah bilangan kitaran di mana pendarfluor produk PCR dapat dikesan di atas dan di atas isyarat latar belakang. Secara ringkasnya, nilai Ct merujuk kepada bilangan kitaran selepas virus itu boleh dikesan. Jika bilangan kitaran yang lebih tinggi diperlukan, ini menunjukkan bahawa virus itu tidak dapat dikesan apabila bilangan kitaran lebih rendah. Semakin rendah nilai Ct, semakin tinggi viral load — kerana virus telah dikesan selepas kurang kitaran.

Surat berita| Klik untuk mendapatkan penerangan terbaik hari ini dalam peti masuk anda

Mengapakah nilai CT penting?

Untuk meletakkannya dalam konteks, mari kita lihat nasihat ICMR dan surat Maharashtra kepada ICMR. Menurut ICMR, pesakit dianggap positif Covid jika nilai Ct di bawah 35. Dengan kata lain, jika virus itu dapat dikesan selepas 35 kitaran atau lebih awal, maka pesakit itu dianggap positif. Jika penanda aras diturunkan kepada 24 — nilai yang disebut dalam surat Maharashtra — ini bermakna nilai Ct dalam julat 25-34 tidak akan dianggap positif. Penanda aras 35, oleh itu, bermakna lebih ramai pesakit akan dianggap positif daripada yang kita akan dapat jika penanda aras adalah 24. ICMR telah berkata menurunkan parameter ambang Ct boleh menyebabkan kehilangan beberapa orang berjangkit.

Seseorang boleh menganggap nilai Ct sebagai ukuran potensi penghantaran, kata pakar virologi terkemuka Dr Shahid Jameel. Jadi jika terdapat lebih banyak virus dalam tekak dan hidung saya, saya akan menghantarnya dengan lebih baik, kata Dr Jameel, yang merupakan Pengarah Trivedi School of Biosciences di Universiti Ashoka.

Apakah kepentingan ambang ICMR 35?

Di peringkat global, pemotongan nilai Ct yang diterima untuk Covid-19 berjulat antara 35 dan 40, bergantung pada arahan daripada pengeluar peralatan ujian masing-masing. ICMR telah mencapai nilai Ct 35 berdasarkan pengalaman makmal dan input yang diambil dari beberapa makmal virologi.

Tiada nasihat baharu, tetapi ICMR memaklumkan kepada kerajaan Maharashtra bahawa tidak digalakkan menggunakan parameter ambang kitaran yang lebih rendah kerana ia akan menyebabkan kehilangan beberapa orang berjangkit dan meningkatkan penularan penyakit, kata Dr Balram Bhargava, DG ICMR.

Adakah terdapat sebarang korelasi antara nilai Ct dan keterukan penyakit?

Tidak. Walaupun nilai Ct berkorelasi songsang dengan viral load, Ia tidak mempunyai sebarang kaitan dengan keterukan penyakit, kata pakar. Pesakit boleh mempunyai nilai Ct yang rendah, yang bermaksud viral loadnya cukup tinggi untuk dikesan dengan cepat, tetapi dia mungkin masih tanpa gejala.

Satu kajian kecil yang diterbitkan dalam Jurnal Mikrobiologi Perubatan India pada Januari tahun ini mendapati bahawa tiada korelasi antara nilai Ct dan keterukan penyakit atau kematian pada pesakit dengan penyakit Covid-19. Ia mendapati bahawa masa sejak permulaan simptom mempunyai hubungan yang lebih kuat dengan nilai Ct berbanding dengan keterukan penyakit.

Nilai Ct memberitahu kita tentang viral load di kerongkong dan bukan di dalam paru-paru, kata Dr Parikshit Prayag, perunding untuk penyakit berjangkit di Hospital Deenanath Mangeshkar, Pune. Nilai Ct tidak berkorelasi dengan keterukan - hanya dengan kejangkitan. Dalam laporan pertama saya tidak benar-benar melihat nilai Ct, tetapi untuk susulan pesakit di hospital, saya mempertimbangkan nilai Ct, kerana kemudian saya boleh memutuskan sama ada untuk memindahkan pesakit ke bangunan bukan Covid atau tidak. . Dari sudut infektiviti, ia boleh menjadi penting, bukan keterukan, kata Dr Prayag.

Adakah nilai Ct yang tinggi sentiasa bermakna viral load yang rendah?

Walaupun itu mungkin kesimpulan yang jelas, sesetengah pakar menekankan bahawa sesetengah pesakit boleh mempunyai nilai Ct yang tinggi namun mempunyai tahap jangkitan Covid-19 yang sangat ketara, dan sebaliknya. Banyak faktor penting dalam mentafsir ujian RT-PCR, dan keputusan juga mungkin bergantung pada kaedah pengumpulan spesimen dan masa dari jangkitan ke pengumpulan dan analisis.

Nasihat ICMR pada Ogos tahun lepas menyatakan bahawa nilai Ct bergantung pada cara sampel telah dikumpulkan. Sampel yang dikumpul dengan buruk mungkin mencerminkan nilai Ct yang tidak sesuai. Selain itu, nilai Ct juga ditentukan oleh kecekapan teknikal orang yang melakukan ujian, penentukuran peralatan, dan kemahiran analisis jurubahasa.

Sekali lagi, nilai Ct mungkin berbeza antara spesimen hidung dan oropharyngeal yang dikumpul daripada individu yang sama. Suhu pengangkutan, serta masa yang diambil dari pengumpulan hingga penerimaan di makmal, juga boleh memberi kesan buruk kepada nilai Ct.

Kongsi Dengan Rakan Anda: