Diterangkan: Mengapa varian Delta Covid-19 merebak lebih cepat daripada strain lain

Lebih ramai orang yang dijangkiti varian Delta Covid-19 berkemungkinan menyebarkan jangkitan itu kepada orang lain sebelum mereka mengesyaki mereka mungkin sakit.

Seorang penjual yang memakai topeng muka sebagai langkah berjaga-jaga terhadap coronavirus mempamerkan mainan untuk dijual di pantai Fort Kochi di Kochi, Kerala, Isnin, 23 Ogos 2021. (Foto AP: R S Iyer)

Apabila saintis mendapati diri mereka berlumba dengan masa untuk mencari asas biologi untuk penghantaran varian Delta Covid-19, beberapa kajian baharu mendapati bahawa mutasi utama mengurangkan keberkesanan vaksin , dan kejangkitan yang tinggi semasa fasa pra-gejala pada pesakit adalah antara sebab utama yang mendorong penyebaran pesat.

Penyelidikan epidemiologi terkini mencadangkan varian Delta (B.1.617.2) sekurang-kurangnya 40 peratus lebih mudah ditularkan daripada varian Alpha yang mula dikenal pasti di UK pada akhir 2020. Selain itu, dengan pelbagai kajian menunjukkan pengurangan kecekapan vaksin terhadap varian Delta, individu yang divaksin sepenuhnya juga kekal terdedah kepada jangkitan terobosan .

Ketua WHO Tedros Adhanom Ghebreyesus, pada taklimat akhbar, sebelum ini berkata bahawa Delta adalah varian yang paling mudah ditularkan dikenal pasti setakat ini, dan ia cepat menjadi strain Covid-19 yang dominan di banyak negara. Menurut pembentangan dalaman yang diedarkan dalam Pusat Kawalan dan Pencegahan Penyakit (CDC) AS, varian Delta ialah lebih mudah ditularkan daripada virus yang menyebabkan MERS, SARS, Ebola, selesema biasa, selesema bermusim dan cacar, dan ia sekurang-kurangnya berjangkit seperti cacar air.

Sumber: JHU CSSE dan covariants.org

Mengapakah varian Delta lebih menular?

Penyelidikan terkini menunjukkan bahawa mutasi asid amino utama mungkin berada di sebalik kejangkitan ganas varian Delta.

Pasukan penyelidik yang diketuai oleh ahli virologi Cawangan Perubatan Universiti Texas Pei-Yong Shi telah memusatkan perhatian pada mutasi utama yang mengubah satu asid amino dalam protein spike SARS-CoV-2. Perubahan itu dipanggil P681R dan mengubah sisa prolin menjadi arginin, menurut laporan kajian yang diterbitkan dalam jurnal Nature. Perubahan berlaku di tapak belahan furin protein spike.

Untuk menembusi sel, protein spike SARS-CoV-2 mesti dipotong dua kali oleh protein perumah. Tapak belahan furin dalam Covid-19 adalah penting kerana ini bermakna enzim perumah, termasuk furin, boleh membuat pemotongan pertama. Selepas ini, zarah virus yang baru terbentuk muncul daripada sel yang dijangkiti yang boleh menjangkiti sel perumah dengan lebih cekap.

Varian Alpha juga membawa mutasi di lokasi yang sama, walaupun ia terdiri daripada perubahan dalam asid amino yang berbeza. Kajian itu menyatakan bahawa dalam kes Delta, mutasi yang mengubah belahan furin mempunyai kesan yang mendalam.

Dalam pracetak kajian yang disediakan baru-baru ini, para penyelidik menyatakan bahawa protein spike dipotong jauh lebih cekap dalam zarah varian Delta berbanding Alpha, dengan mutasi P681R sebahagian besarnya bertanggungjawab untuk spike dipotong dengan cekap.

Kajian itu menyatakan bahawa mutasi P681R memegang kunci kepada kebolehjangkitan tinggi varian Delta dan penghantaran pantas. Para penyelidik mendapati bahawa dalam sel epitelium saluran pernafasan manusia yang dijangkiti, varian Delta merebak lebih cepat daripada Alpha. Tetapi apabila penyelidik mengeluarkan mutasi P681R, perbezaan dalam kadar penghantaran telah hilang.

Kajian itu menyuarakan penemuan penyelidikan yang dijalankan oleh pasukan yang diketuai oleh Kei Sato, ahli virologi di Universiti Tokyo, yang mendapati bahawa protein spike yang menanggung P681R boleh bergabung dengan membran plasma sel yang tidak dijangkiti hampir tiga kali lebih cepat daripada jika mutasi. sedang hilang.

Sumber: CoVariants.org dan GISAID melalui Our World in Data

Adakah mutasi utama lain juga bertanggungjawab untuk penghantaran pantas Delta?

Para saintis mengatakan bahawa varian Delta mempunyai beberapa mutasi utama dan perubahan P681R, walaupun ketara, tidak mungkin menjadi satu-satunya sebab yang memacu transmisi pantasnya.

Penyelidik di Uganda berkata perubahan P681R hadir dalam varian yang tersebar luas di negara ini pada awal 2021, tetapi tidak terbukti menular seperti Delta. The Varian Kappa , adik beradik Delta yang dikenal pasti di India, juga mempunyai mutasi yang sama tetapi penyelidik mendapati protein spikenya dibelah kurang kerap dan melebur ke membran sel dengan kurang cekap.

Kajian terdahulu mendapati bahawa mutasi utama lain dalam varian Delta seperti L452R dan D6146 membolehkan virus melekat lebih kukuh pada sel reseptor dan melepaskan imuniti dengan lebih mudah.

Malah, varian Delta mempunyai pelbagai mutasi dalam subunit S1 protein spike, termasuk tiga dalam domain pengikat reseptor, yang meningkatkan keupayaannya untuk mengikat reseptor ACE2 dan mengelak sistem imun badan.

Saya fikir virus itu berjaya pada kelantangan dan kelajuan. Ia menjadi virus yang lebih cekap. Ia melalui orang dan melalui sel dengan lebih cepat, Gary Whittaker, ahli virologi di Universiti Cornell, memberitahu Alam.

Whittaker selanjutnya berkata kajian itu telah menggariskan kepentingan mutasi di tapak pembelahan furin coronavirus. Beliau juga menambah bahawa P681R tidak akan menjadi mutasi tapak belahan furin terakhir yang menimbulkan kebimbangan.

Sumber: CoVariants.org dan GISAID melalui Our World in Data

Mengapakah sukar untuk menghentikan varian Delta daripada merebak?

Salah satu sebab lain untuk penyebaran pesat varian Delta, seperti yang ditemui semasa kajian di Guangzhou, China, adalah tahap kejangkitan yang sangat tinggi pada pesakit walaupun dalam fasa pra-gejala. Ini bermakna orang ramai berada dalam bahaya menyebarkan virus itu walaupun sebelum mengesyaki bahawa mereka mungkin dijangkiti.

Kajian terbaru oleh Benjamin Cowling, ahli epidemiologi di Universiti Hong Kong dan rakan-rakannya, mendapati bahawa orang mula mengalami gejala 5.8 hari selepas jangkitan Delta - 1.8 hari selepas mereka mula-mula diuji positif untuk RNA virus. Oleh itu, ini meninggalkan tingkap berbahaya untuk penularan virus berlaku.

Dalam erti kata lain, sejak permulaan simptom berlaku kemudian, lebih ramai orang yang dijangkiti varian Delta berkemungkinan menyebarkan jangkitan kepada orang lain walaupun sebelum mereka mengesyaki bahawa mereka mungkin sakit.

Kajian mendapati bahawa 74% jangkitan Delta berlaku semasa fasa pra-gejala. Para penyelidik juga mendapati bahawa R-naught, atau nombor pembiakan asas, yang mewakili, secara purata, bilangan orang yang seseorang yang dijangkiti boleh dijangka menularkan penyakit itu, untuk Delta ialah 6.4. Untuk meletakkan sesuatu ke dalam perspektif, R-nought dari strain Wuhan, menurut beberapa kajian yang dilakukan sebelum ini, adalah antara 2 hingga 4.

Adakah pengurangan keberkesanan vaksin terhadap Delta merupakan perkara yang membimbangkan?

Beberapa kajian mendapati bahawa keberkesanan vaksin dikurangkan terhadap varian Delta, yang seterusnya menyebabkan individu yang telah divaksin sepenuhnya terdedah kepada jangkitan terobosan.

Kajian awal oleh Public Health England telah mendapati bahawa keberkesanan vaksin Oxford-AstraZeneca turun kepada 64% berbanding varian Delta . Terdahulu, kajian yang diterbitkan dalam jurnal The Lancet juga mendapati bahawa mereka yang divaksin sepenuhnya dengan vaksin Pfizer berkemungkinan lebih daripada lima kali tahap antibodi peneutral yang lebih rendah terhadap varian Delta berbanding strain asal.

Baru-baru ini, data daripada Kementerian Kesihatan Israel telah menunjukkan bahawa dua suntikan Pfizer menawarkan perlindungan 64%. terhadap Covid, pada masa lebih 90 peratus daripada kes yang dilaporkan di negara ini disebabkan oleh varian Delta.

Satu lagi bidang yang membimbangkan ialah keberkesanan vaksin yang semakin berkurangan dari semasa ke semasa. Penyelidik di Universiti Oxford di UK dan Pejabat Statistik Kebangsaan negara itu dalam kajian baru-baru ini mendapati bahawa keberkesanan vaksin Pfizer turun kepada 90 peratus sebulan selepas mengambil dos kedua, kepada 85 peratus selepas dua bulan dan 78 peratus selepas tiga. Bagi AstraZeneca, perlindungan setara yang ditawarkan ialah 67, 65 dan 61 peratus.

Kajian itu juga mendapati bahawa walaupun pada orang yang diberi vaksin sepenuhnya, jangkitan yang disebabkan oleh varian Delta menghasilkan beban virus puncak yang serupa dengan individu yang tidak divaksinasi. Kajian yang dijalankan di AS dan Singapura telah menghasilkan keputusan yang sama.

Ini bermakna perkara yang paling membimbangkan ialah orang yang telah divaksin sepenuhnya boleh menyebarkan varian Delta, yang menjadikannya sangat sukar untuk memutuskan rantaian penularan.

Laporan yang diterbitkan oleh CDC bulan ini menyatakan bahawa berikutan perhimpunan besar di bandar pantai Provincetown di Massachusetts, 469 kes Covid-19 dilaporkan di negeri itu, di mana hampir tiga perempat daripadanya adalah dalam kalangan orang yang diberi vaksin.

Pada analisis didapati bahawa sama seperti orang yang tidak divaksin, mereka yang telah mengambil suntikan juga mempunyai tahap yang tinggi Nilai Ct , menunjukkan viral load yang tinggi. Selepas penjujukan genom 133 sampel, 90% daripada kes didapati disebabkan oleh varian Delta. Berikutan penemuan itu, CDC pada 27 Julai mengemas kini garis panduannya sekali lagi, dan mengesyorkan dan juga orang yang diberi vaksin harus memakai topeng apabila berada di kawasan yang mempunyai penularan Covid-19 yang besar dan tinggi.

Kongsi Dengan Rakan Anda: