Diterangkan: Seberapa cepat strain coronavirus baharu merebak? Adakah ia akan menjejaskan vaksinasi?

Strain coronavirus baharu di UK: India dan beberapa negara lain telah menggantung penerbangan ke dan dari UK. Apakah mutasi yang telah membawa kepada varian coronavirus yang telah menimbulkan kebimbangan? Seberapa cepat ia merebak? Dan adakah ia akan memberi kesan kepada vaksinasi?

Penerbangan dari Britain dibatalkan di lapangan terbang Cointrin, di Geneva, Switzerland, 21 Disember 2020. (Foto Reuters: Denis Balibouse)

Pada hari Isnin India menangguhkan semua penerbangan dari dan ke UK sehingga 31 Disember, di tengah-tengah kebimbangan mengenai a varian baru SARS-CoV-2 yang merebak & berkembang pesat di sana. Beberapa negara lain juga telah menggantung penerbangan UK dan mengenakan sekatan perjalanan.

Apakah kebimbangan ini yang membawa kepada sekatan perjalanan?

Minggu lalu, varian SARS-CoV-2 baharu telah didedahkan sebagai punca di sebalik lonjakan pesat kes Covid-19 di England Selatan dan Timur. Ia dirujuk sebagai VUI (Variant Under Investigation) 202012/01, atau keturunan B.1.1.7.

Sejak beberapa hari kebelakangan ini, terima kasih kepada keupayaan genomik bertaraf dunia kami, kami telah mengenal pasti varian baharu coronavirus , yang mungkin dikaitkan dengan penyebaran lebih pantas di Selatan England, Setiausaha Kesihatan UK Matt Hancock memberitahu Dewan Rakyat pada 14 Disember. Pihak berkuasa UK telah pun memaklumkan kepada Pertubuhan Kesihatan Sedunia tentang varian tersebut.

Public Health England (PHE) mengumumkan bahawa 1,108 kes dengan varian ini telah dikenal pasti setakat 13 Disember, kebanyakannya di Selatan dan Timur England. PHE sedang bekerjasama dengan rakan kongsi untuk menyiasat dan merancang untuk berkongsi penemuannya dalam tempoh 2 minggu akan datang, katanya.

Macam mana variannya?

Varian itu dikenal pasti dalam pengawasan genom oleh COVID-19 Genomics UK (COG-UK), sebuah konsortium yang menganalisis data penjujukan genom dari UK. COG-UK ialah penyumbang terbesar kepada pangkalan data Covid-19 global GISAID.

Varian ini adalah hasil daripada pelbagai mutasi dalam protein lonjakan novel coronavirus SARS-CoV-2, serta mutasi di kawasan genomik lain virus RNA. Analisis awal menunjukkan bahawa ia lebih mudah ditularkan daripada varian yang beredar sebelum ini. COG-UK mengenal pasti salah satu mutasi ini sebagai N501Y, di kawasan protein spike yang mengikat protein utama dalam sel manusia, reseptor ACE2. Ini adalah petunjuk bahawa perubahan boleh, secara teori, mengakibatkan virus menjadi lebih menular. Usaha sedang dijalankan untuk mengesahkan sama ada mana-mana mutasi ini menyumbang kepada peningkatan penghantaran, kata konsortium itu.

Apa yang kita tahu setakat ini tentang kebolehjangkitan, dan keterukan penyakit?

Pada hari Ahad, PHE berkata data daripada penjujukan seluruh genom, epidemiologi dan pemodelan menunjukkan bahawa varian baharu itu menghantar lebih mudah berbanding strain lain.

Walau bagaimanapun, ia juga menekankan bahawa tiada bukti bahawa varian itu lebih berkemungkinan menyebabkan penyakit atau kematian yang teruk. … Tetapi kami meneruskan siasatan untuk memahami perkara ini dengan lebih baik, katanya. Ia berkata kematian adalah penunjuk yang ketinggalan dan ia akan terus memantaunya dalam beberapa minggu akan datang.

PHE berkata ia belum tahu lagi mekanisme untuk peningkatan transmisi ini. Kita tahu bahawa mutasi dalam protein spike, bahagian virus yang menjadikannya berjangkit, boleh mengubah cara virus berinteraksi dengan sel manusia, katanya.

Ia berkata bukti menunjukkan bahawa kadar jangkitan di kawasan geografi di mana strain tertentu ini telah beredar telah meningkat lebih cepat daripada yang dijangkakan, dan bukti pemodelan telah menunjukkan bahawa varian ini mempunyai kadar penghantaran yang lebih tinggi daripada varian lain dalam edaran semasa.

Strain coronavirus baharu di UK: Seorang pegawai polis mengarahkan lalu lintas di pintu masuk ke terminal feri tertutup di Dover, England, Isnin, selepas Pelabuhan Dover ditutup. (Foto AP)

Sejauh mana kebimbangan adalah kebolehtransmisian yang lebih tinggi?

Pada 18 Disember, Kumpulan Penasihat Ancaman Virus Pernafasan Baru dan Muncul (NERVTAG), yang menasihati kerajaan UK mengenai ancaman yang ditimbulkan oleh virus pernafasan baharu dan baru muncul, berkata varian baharu itu berpotensi meningkatkan bilangan pembiakan penyakit itu sehingga 0.93 . Ia berkata ia mempunyai keyakinan sederhana bahawa varian baharu itu menunjukkan peningkatan ketara dalam kebolehtransmisian berbanding varian lain.

Badan pakar itu, bagaimanapun, membuat kesimpulan bahawa pada masa ini terdapat data yang tidak mencukupi untuk membuat sebarang kesimpulan mengenai mekanisme asas peningkatan kebolehjangkitan, taburan umur kes dan keterukan penyakit. Ia mengatakan 4 kematian dalam kira-kira 1,000 kes telah dikenal pasti, tetapi kerja lanjut diperlukan untuk membandingkan kadar kematian ini dengan set data yang setanding.

Lokasi mutasi dalam domain pengikat reseptor glikoprotein spike menimbulkan kemungkinan bahawa varian ini berbeza secara antigen daripada varian sebelumnya. Empat kemungkinan jangkitan semula telah dikenal pasti dalam kalangan 915 subjek dengan varian ini tetapi kerja lanjut diperlukan untuk membandingkan kadar jangkitan semula ini dengan set data yang setanding, katanya.

Pada hari Ahad, ringkasan penilaian ancaman yang diterbitkan oleh Pusat Pencegahan dan Kawalan Penyakit Eropah berkata analisis filogenetik mendedahkan bahawa kluster itu berbeza dengan 29 penggantian nukleotida daripada strain Wuhan asal. Tiga urutan dari Denmark dan satu dari Australia, daripada sampel yang dikumpul pada November 2020, berkelompok dengan varian UK, kemungkinan besar menunjukkan bahawa penyebaran antarabangsa telah berlaku, walaupun sejauh mana masih tidak diketahui, katanya.

Strain coronavirus baharu di UK: Pelabuhan Dover ditutup apabila negara EU mengenakan larangan perjalanan dari UK. (Foto Reuters)

Tetapi adakah virus itu tidak bermutasi sebelum ini?

Setiap kali virus mereplikasi dan beredar dalam populasi manusia, mutasi berlaku secara semula jadi, pada kadar sekitar satu hingga dua mutasi setiap bulan dalam filogeni global.

Malah, untuk SARS-CoV-2, COG-UK mengatakan bahawa pada masa ini terdapat sekitar 4,000 mutasi dalam protein spike. Varian D614G lebih awal daripada strain dominan kerana ia merebak dengan sangat mudah. Satu lagi strain yang berasal dari pekerja ladang Sepanyol, 20A. EU1, merebak dengan cepat ke seluruh Eropah pada musim panas.

Sukar untuk meramalkan sama ada sebarang mutasi adalah penting apabila ia mula-mula muncul, dengan latar belakang kemunculan berterusan mutasi baharu. Memahami kepentingannya mungkin mungkin berdasarkan kerja eksperimen yang menunjukkan hubungan antara mutasi dan perubahan halus dalam biologi virus. Walau bagaimanapun, ia akan mengambil masa dan usaha yang besar untuk menguji kesan beribu-ribu kombinasi mutasi, kata COG-UK.

Adakah ia memberi kesan kepada pembangunan dan tindak balas vaksin?

Pada hari Ahad, pihak berkuasa UK berkata kerja makmal lanjut sedang dijalankan sebagai keutamaan untuk memahami perkara ini. Pada masa ini tiada bukti yang menunjukkan bahawa vaksin Pfizer tidak akan melindungi orang daripada strain baru, kata PHE.

Kongsi Dengan Rakan Anda: